Zakład Badań Polarnych współpracuje z 25 ośrodkami z Polski i 35 instytucjami zagranicznymi.
Akademia Górniczo-Hutnicza w Krakowie
Politechnika Warszawska
Akademia Morska, Gdynia
Akademia Świętokrzyska
Akademia Rolnicza we Wrocławiu
Uniwersytet Adama Mickiewicza w Poznaniu
Centrum Badań Kosmicznych PAN
Uniwersytet Białostocki
Geofizyka Toruń
Uniwersytet Gdański
Instytut Botaniki PAN w Krakowie
Uniwersytet Jagielloński
Centrum Badań Ekologicznych PAN
Uniwersytet Marii Curie Skłodowskiej w Lublinie
Instytut Geodezji i Kartografii, Warszawa
Uniwersytet Mikołaja Kopernika w Toruniu
Instytut Meteorologii i Gospodarki Wodnej, Gdynia
Uniwersytet w Szczecinie
Instytut Nauk Geologicznych PAN, Kraków
Uniwersytet Śląski
Instytut Oceanologii PAN, Sopot
Uniwersytet Warszawski
Instytut Paleobiologii PAN
Uniwersytet Wrocławski
Instytut Problemów Jądrowych, Świerk
Zakład Biologii Antarktyki PAN
Alaska Science Center U.S. Geological Survey, Anchorage, USA
Alfred-Wegener-Institute for Polar and Marine Research, Potsdam, Germany
Arctic Centre of the University of Lapland, Rovaniemi, Finland
Česká Speleologická Společnost, Czech
Geophysics Department of the University of Oulu, Finland
Geophysics Observatory of the Finnish Academy of Sciences, Sodankylä, Finland
Geophysical Research Division of the Finnish Meteorological Institute, FMI/GEO, Finland
Centro de Investigaciones Cientificas, Havana, Cuba
Institute of Geography of the Russian Academy of Sciences, Moscow, Russia
Institut Polaire Francais, Plouzané, France
INTERMAGNET (International Real-time Magnetic Observatory Network), England
International Monitor for Auroral Geomagnetic Effects (IMAGE), Finland
Murmansk Marine Biological Institute of the Russian Academy of Sciences, Murmansk, Russia
NORSAR (Norwegian Seismic Array), Norway
Norsk Polarinstitutt, Tromso, Norway
Norwegian Meteorological Institute, Tromso, Norway
Nurmijärvi Geophysical Observatory of the Finnish Meteorological Institute, Röykkä, Finland
Polar Geophysical Institute RAS, Apatity, Russia
The Arctic and Antarctic Reserch Institute, St.Petersburg, Russia
Swedish Institute of Space Physics, Kiruna, Sweden
Swiss Federal Institute of Technology (ETH), Zurich, Switzerland
The Norwegian Institute for Nature Research (NINA), Norway
Trust ARCTICUGOL, Barentsburg, Svalbard
Ultra Violet Radiation in Arctic (UVRAPPF), European Union
University of Alaska, Fairbanks, USA
University of Bergen, Norway
University of California, USA
University Courses on Svalbard (UNIS), Norway
University of Oslo, Norway
Université du Québec á Montréal, Canada
University of Tromso, Norway
Vitenskapsmuseet, University of Trondheim, Norway
US Geological Survay, National Earthquake International Centre (NEICE), USA
World Data Centre C1 for Geomagnetism (WDC-C1), Copenhagen, Denmark